61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02674 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02674  protease  100 
 
 
176 aa  346  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.93 
 
 
617 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  48.02 
 
 
620 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.64 
 
 
802 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.69 
 
 
807 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  35.34 
 
 
777 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.83 
 
 
629 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  31.9 
 
 
489 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  33.71 
 
 
560 aa  82  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.79 
 
 
629 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.79 
 
 
629 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  35.26 
 
 
803 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 
579 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.81 
 
 
818 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.75 
 
 
629 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.19 
 
 
809 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.19 
 
 
805 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.19 
 
 
805 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  32.9 
 
 
807 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
823 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  29.75 
 
 
534 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.64 
 
 
819 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  38.83 
 
 
553 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.64 
 
 
819 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.64 
 
 
819 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.64 
 
 
819 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  40.62 
 
 
778 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  30.68 
 
 
789 aa  72.4  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  40.62 
 
 
778 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.97 
 
 
807 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.62 
 
 
628 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  37.84 
 
 
775 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  40.62 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.82 
 
 
494 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  33.12 
 
 
794 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  39.58 
 
 
778 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  36.73 
 
 
535 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  35.65 
 
 
658 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.09 
 
 
803 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.11 
 
 
630 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  37.08 
 
 
533 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  31.58 
 
 
501 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  32.33 
 
 
774 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  38.55 
 
 
789 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  31.63 
 
 
823 aa  58.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  32 
 
 
677 aa  57.8  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  35.79 
 
 
609 aa  58.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  32.41 
 
 
553 aa  57.8  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.13 
 
 
520 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  30 
 
 
701 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  35.23 
 
 
558 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  36.08 
 
 
539 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  34.09 
 
 
558 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  33.93 
 
 
542 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  31.73 
 
 
492 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  30.86 
 
 
968 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  35.29 
 
 
852 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  30.49 
 
 
1005 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  64.86 
 
 
454 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  30.43 
 
 
808 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28282  predicted protein  41.18 
 
 
3288 aa  41.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>