234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1218 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  51.39 
 
 
725 aa  702    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  68.24 
 
 
725 aa  973    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  68.24 
 
 
725 aa  973    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  100 
 
 
728 aa  1475    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  55.56 
 
 
732 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  95.18 
 
 
729 aa  1324    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  72.59 
 
 
730 aa  1043    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  60.58 
 
 
731 aa  841    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  48.48 
 
 
736 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  61.15 
 
 
731 aa  852    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  55.56 
 
 
731 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  67.81 
 
 
725 aa  969    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  68.52 
 
 
725 aa  973    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  49.06 
 
 
739 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  48.1 
 
 
744 aa  628  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  48.2 
 
 
733 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  48.06 
 
 
733 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  47.41 
 
 
734 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  48.14 
 
 
734 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  48.27 
 
 
734 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  48.27 
 
 
734 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.83 
 
 
733 aa  591  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  48.33 
 
 
733 aa  588  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  47.25 
 
 
733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  47.25 
 
 
733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  47.25 
 
 
733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  47.25 
 
 
733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  47.25 
 
 
733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  47.25 
 
 
733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  47.25 
 
 
733 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  41.09 
 
 
726 aa  505  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  40.8 
 
 
726 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.74 
 
 
722 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  40.88 
 
 
727 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  40.37 
 
 
726 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  40.88 
 
 
727 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.1 
 
 
745 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.1 
 
 
745 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  41.19 
 
 
727 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.1 
 
 
745 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  41.1 
 
 
745 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  41.1 
 
 
745 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  40.6 
 
 
727 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  40.8 
 
 
727 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  41.1 
 
 
745 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  41 
 
 
743 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  38.38 
 
 
727 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  34.2 
 
 
726 aa  361  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  31.79 
 
 
728 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  32.67 
 
 
727 aa  312  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  43.49 
 
 
411 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  29.97 
 
 
750 aa  227  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  31.23 
 
 
664 aa  201  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  29.11 
 
 
664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.36 
 
 
676 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  31.48 
 
 
679 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  30.94 
 
 
679 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  30.52 
 
 
673 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  30.52 
 
 
673 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  30.52 
 
 
673 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.42 
 
 
676 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  29.69 
 
 
662 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.98 
 
 
676 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  29.37 
 
 
676 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  29.23 
 
 
662 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  29.47 
 
 
662 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.69 
 
 
702 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.82 
 
 
724 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.9 
 
 
704 aa  154  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  26.16 
 
 
670 aa  154  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  26.09 
 
 
697 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  26.55 
 
 
698 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.1 
 
 
653 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 
711 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  28.06 
 
 
724 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.02 
 
 
653 aa  149  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.73 
 
 
697 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.01 
 
 
741 aa  147  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.63 
 
 
672 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  26.44 
 
 
714 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  26.73 
 
 
713 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.19 
 
 
700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  27.37 
 
 
679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  26.64 
 
 
700 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.41 
 
 
691 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.19 
 
 
688 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.77 
 
 
670 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.57 
 
 
692 aa  135  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.83 
 
 
699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  27.94 
 
 
679 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  27.64 
 
 
663 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.93 
 
 
699 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  27.29 
 
 
670 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.16 
 
 
680 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.42 
 
 
687 aa  128  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  27.44 
 
 
670 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.17 
 
 
680 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.29 
 
 
670 aa  125  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.29 
 
 
670 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.13 
 
 
670 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>