More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1795 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  96.83 
 
 		 290 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  95.77 
 
 		 284 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  82.75 
 
 		 284 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  63.96 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  63.96 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  63.6 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  61.29 
 
 		 285 aa  348  5e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  60.79 
 
 		 296 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  60.07 
 
 		 284 aa  347  9e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 284 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 284 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 284 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 284 aa  321  8e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 		 284 aa  320  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  55.47 
 
 		 284 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  48.42 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 288 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 289 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  47.83 
 
 		 296 aa  275  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  46.32 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  49.27 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  48.55 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 288 aa  265  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.01 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  47.1 
 
 		 300 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  46.74 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  46.35 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  46.93 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  47.29 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  43.82 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  45.04 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  43.73 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  42.75 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  44.85 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  42.01 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  42.75 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  44.91 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 		 284 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  45.13 
 
 		 289 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  44.49 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  42.03 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  42.03 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  44.41 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  42.03 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  42.46 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  42.03 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  44.41 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  46.72 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  40.94 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  41.81 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  43.42 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  41.82 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 		 285 aa  234  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  41.81 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  43.36 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  41.81 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  42.09 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  40.77 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  42.24 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  44.93 
 
 		 292 aa  231  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  40.58 
 
 		 290 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  43.06 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  41.11 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  43.16 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  43.37 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  42.11 
 
 		 284 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  41.96 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  43.8 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  43.8 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  42.11 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  41.79 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  40.21 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  42.97 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  40.36 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  42.35 
 
 		 282 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  40.78 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  40 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  43.84 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  42.45 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  40.21 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  41.7 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>