More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28468 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28468  quinone oxidoreductase  100 
 
 		 362 aa  733    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00993002  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74654  quinone oxidoreductase  43.72 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.907908  normal  0.0207844 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07199  conserved hypothetical protein  40.12 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.528033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  38.62 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.35 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  37.43 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  37.58 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.69 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05880  cytoplasm protein, putative  36.2 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  36.16 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.22 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.14 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.71 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32 
 
 		 338 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 340 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  32 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.49 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.27 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.54 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  33.43 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  33.43 
 
 		 469 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  33.43 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.67 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  33.43 
 
 		 479 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  33.43 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  33.43 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  33.14 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.84 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.43 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.23 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.73 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  35.93 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.59 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.27 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  31.73 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.93 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 		 354 aa  169  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.62 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.27 
 
 		 332 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.27 
 
 		 332 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.27 
 
 		 332 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.27 
 
 		 332 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.27 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.34 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 		 332 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.27 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.45 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  33.44 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  31.65 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.65 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.57 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.4 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.52 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 		 334 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>