170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_13471 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_13471  RNA-binding protein  100 
 
 
165 aa  340  5.999999999999999e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0775963 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03953  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08040)  53.7 
 
 
353 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748027  normal  0.180065 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10530  predicted protein  47.96 
 
 
103 aa  101  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01030  conserved hypothetical protein  38.57 
 
 
254 aa  99  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.584283  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13402  predicted protein  37.04 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  39.74 
 
 
434 aa  70.9  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  37.18 
 
 
477 aa  65.5  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  37.5 
 
 
393 aa  64.3  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  33.71 
 
 
524 aa  61.6  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
125 aa  57.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  32.26 
 
 
453 aa  57.8  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  29.07 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  37.1 
 
 
89 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  35.38 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  31.58 
 
 
605 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  33.87 
 
 
103 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  32.88 
 
 
856 aa  51.6  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  29.87 
 
 
441 aa  51.6  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  30.67 
 
 
114 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  34.85 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  34.85 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  36.71 
 
 
690 aa  50.8  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  36.36 
 
 
352 aa  50.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  29.49 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  32.47 
 
 
81 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.26 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  33.33 
 
 
673 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  30.88 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  43.33 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  37.7 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  30.43 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
86 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  34.92 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  33.33 
 
 
328 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  32.47 
 
 
446 aa  48.9  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  31.58 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
102 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
83 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  31.58 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
103 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  29.11 
 
 
97 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  32.26 
 
 
838 aa  47.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  30.26 
 
 
132 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  26.09 
 
 
90 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  34.33 
 
 
304 aa  47.4  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00421  Multiple RNA-binding domain-containing protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGA9]  31.25 
 
 
819 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.857696  normal  0.9634 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  32.47 
 
 
552 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  36.51 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  39.51 
 
 
499 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  29.51 
 
 
97 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
181 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  32.89 
 
 
319 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
105 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  26.19 
 
 
250 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  28.57 
 
 
122 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  31.58 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  26.19 
 
 
250 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  29.49 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10276  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07120)  32.14 
 
 
138 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.012473  normal  0.330154 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  30 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
107 aa  45.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  32 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  32.84 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  25 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  34.43 
 
 
76 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  29.03 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  26.44 
 
 
104 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217942 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  35.48 
 
 
724 aa  45.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
98 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  29.03 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 
98 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  26.92 
 
 
222 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  29.49 
 
 
572 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  28 
 
 
90 aa  44.7  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  34.33 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
99 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3300  RNA-binding region RNP-1  30.77 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.181276  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  32.1 
 
 
481 aa  44.3  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  25 
 
 
687 aa  44.3  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
92 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  29.03 
 
 
95 aa  44.3  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  26.67 
 
 
82 aa  44.3  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
92 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 
95 aa  43.9  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>