More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19604 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_19604  predicted protein  100 
 
 		 363 aa  746    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  48.91 
 
 		 965 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  46.22 
 
 		 945 aa  301  8.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28688  predicted protein  46.2 
 
 		 936 aa  288  8e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163307  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68406  predicted protein  42.62 
 
 		 999 aa  280  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.094593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 		 893 aa  235  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 		 828 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  38.62 
 
 		 900 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 		 871 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 		 881 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 823 aa  225  8e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.57 
 
 		 882 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 888 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 888 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 854 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 		 889 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 869 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 882 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 		 872 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 887 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 905 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 882 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 854 aa  222  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 		 873 aa  222  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.64 
 
 		 870 aa  222  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 895 aa  222  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 883 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 882 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.04 
 
 		 872 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.26 
 
 		 857 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  38.49 
 
 		 885 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  45.02 
 
 		 872 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 		 878 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.06 
 
 		 862 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 		 904 aa  219  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  38.51 
 
 		 856 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  39.94 
 
 		 902 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  38.1 
 
 		 956 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 		 850 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 850 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 896 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  37.07 
 
 		 840 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 855 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 863 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  37.99 
 
 		 859 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  36.81 
 
 		 881 aa  216  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  36.87 
 
 		 856 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 918 aa  216  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 855 aa  216  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45 
 
 		 862 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  38.51 
 
 		 858 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  36.81 
 
 		 872 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  38.55 
 
 		 910 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 853 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 		 871 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 854 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  37.11 
 
 		 926 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  45.66 
 
 		 856 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 853 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 		 868 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 		 871 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  38.49 
 
 		 926 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  45.11 
 
 		 867 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 897 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  39.36 
 
 		 882 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 		 859 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  36.44 
 
 		 872 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 863 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  36.44 
 
 		 872 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 		 892 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  40.82 
 
 		 872 aa  213  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.17 
 
 		 860 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 		 870 aa  212  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  37.61 
 
 		 859 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  37.57 
 
 		 860 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  37.58 
 
 		 901 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  36.6 
 
 		 856 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  36.6 
 
 		 856 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  36.6 
 
 		 856 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  38.87 
 
 		 867 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 854 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  36.34 
 
 		 856 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  37.91 
 
 		 861 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 		 854 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  42.24 
 
 		 1091 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 		 917 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 		 858 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 		 870 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  38.69 
 
 		 819 aa  210  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  46.34 
 
 		 903 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 863 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 		 885 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  36.87 
 
 		 861 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  45.02 
 
 		 930 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 905 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 914 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  40.06 
 
 		 852 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  37.91 
 
 		 861 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 		 886 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  38.15 
 
 		 852 aa  209  8e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>