More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12031 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  100 
 
 		 297 aa  617  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 304 aa  324  9e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  49.66 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 		 287 aa  279  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 289 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 284 aa  278  9e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  47.62 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 286 aa  272  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 		 300 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 287 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  45.59 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  52.45 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.12 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  47.29 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  44.12 
 
 		 293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  46.21 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  46.13 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  48.51 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  45.64 
 
 		 295 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  46.57 
 
 		 284 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 283 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  45.76 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  43.06 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  45.91 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  48.01 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  44.26 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  42.35 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 		 295 aa  244  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  45.59 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  45.49 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  46.57 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  47.76 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  45.49 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  46.21 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  45.05 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  47.39 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  46.69 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  45.05 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 294 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 294 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  47.04 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0452  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  43.11 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  45.85 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  45.13 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 		 284 aa  238  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  44.28 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  42.81 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  44.4 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  45.85 
 
 		 285 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  44.85 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  44.4 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  42.46 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  45.11 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  44.77 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  42.65 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  45.58 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  45.13 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  42.76 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  43.42 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>