More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0074 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  100 
 
 
361 aa  742  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  65.45 
 
 
357 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  60.85 
 
 
357 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 
354 aa  446  1e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 
357 aa  444  1e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 
358 aa  435  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 
357 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 
358 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 
359 aa  416  1e-115  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  54.17 
 
 
370 aa  405  1e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  54.17 
 
 
370 aa  405  1e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  53.61 
 
 
370 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 
355 aa  400  1e-110  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  52.5 
 
 
372 aa  398  1e-110  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 
357 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 
357 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
358 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 
357 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 
359 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 
363 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
360 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.28118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
360 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.61971e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 
367 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 
357 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
360 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.99175e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  51.88 
 
 
360 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 
360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 
360 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 
355 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 
361 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 
360 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  53.3 
 
 
360 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 
359 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
355 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 
363 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
355 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
357 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
359 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  53.68 
 
 
359 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  51.01 
 
 
361 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
356 aa  371  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 
355 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 
358 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.04378e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 
358 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  47.75 
 
 
358 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.02201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  53.04 
 
 
360 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 
358 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.28302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  51.3 
 
 
361 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 
358 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38678e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  51 
 
 
358 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.01474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  51.59 
 
 
360 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 
358 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.02063e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 
361 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.3 
 
 
361 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  48.43 
 
 
356 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  51.88 
 
 
361 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 
362 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  48.02 
 
 
355 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.28855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
358 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 
362 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  48.02 
 
 
355 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.00734e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 
361 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.99484e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 
357 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 
355 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  47.75 
 
 
358 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.10571e-09  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 
355 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 
357 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 
361 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 
363 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.15596e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
358 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
358 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 
360 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  50 
 
 
361 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  52.46 
 
 
360 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 
357 aa  363  2e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 
361 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
354 aa  362  5e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
363 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
363 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  47.92 
 
 
368 aa  362  7e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.02 
 
 
355 aa  362  8e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.69919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  48.56 
 
 
361 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 
363 aa  360  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 
363 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 
363 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 
363 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  4.10243e-05 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 
357 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.53667e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
362 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.01734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 
360 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 
364 aa  360  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 
355 aa  359  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.06535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
363 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
363 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 
355 aa  359  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.88952e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 
364 aa  359  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  53.62 
 
 
360 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
363 aa  358  9e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 
363 aa  357  1e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  48.53 
 
 
362 aa  358  1e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 
356 aa  358  1e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>