More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0064 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.29 
 
 
1048 aa  782  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.61 
 
 
1039 aa  801  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.39 
 
 
1039 aa  800  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  43.62 
 
 
1047 aa  812  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  36.62 
 
 
1052 aa  668  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.09 
 
 
1061 aa  803  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  48.88 
 
 
1041 aa  929  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  45.4 
 
 
1034 aa  864  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  45.74 
 
 
1030 aa  773  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.09 
 
 
1039 aa  792  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.79 
 
 
1037 aa  813  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  42.97 
 
 
1066 aa  769  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.82 
 
 
1049 aa  805  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.75 
 
 
1037 aa  827  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  44.71 
 
 
1043 aa  828  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.71 
 
 
1039 aa  805  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.09 
 
 
1039 aa  792  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  43.62 
 
 
1043 aa  788  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  48.78 
 
 
1045 aa  941  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  47.5 
 
 
1034 aa  879  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  43.99 
 
 
1040 aa  803  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  43.53 
 
 
1043 aa  786  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  44.52 
 
 
1031 aa  818  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  37.85 
 
 
1032 aa  654  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  42.36 
 
 
1039 aa  802  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 
1058 aa  767  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  42.8 
 
 
1039 aa  798  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  44.54 
 
 
1049 aa  790  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  44.31 
 
 
1047 aa  776  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.32 
 
 
1049 aa  803  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  42.46 
 
 
1039 aa  800  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  42.62 
 
 
1058 aa  749  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  41.78 
 
 
1066 aa  796  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.3 
 
 
1092 aa  823  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  42.02 
 
 
1066 aa  797  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  43.02 
 
 
1071 aa  838  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 
1039 aa  2078  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.84 
 
 
1054 aa  727  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  49.51 
 
 
1023 aa  974  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.03 
 
 
1026 aa  818  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.53 
 
 
1049 aa  787  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  44.62 
 
 
1075 aa  811  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  40.12 
 
 
1036 aa  706  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.88 
 
 
1048 aa  837  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.62 
 
 
1053 aa  755  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.97 
 
 
1052 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  36.46 
 
 
1040 aa  614  1e-174  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 
1054 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.01 
 
 
1065 aa  607  1e-172  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.71 
 
 
1033 aa  608  1e-172  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  35.46 
 
 
1069 aa  606  1e-172  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.35 
 
 
1032 aa  606  1e-172  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  34.39 
 
 
1034 aa  603  1e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  37.11 
 
 
1023 aa  605  1e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.87 
 
 
1034 aa  604  1e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.12 
 
 
1034 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  35.77 
 
 
1075 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  34.94 
 
 
1076 aa  595  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.35 
 
 
1029 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  34.94 
 
 
1082 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.7 
 
 
1070 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.61 
 
 
1070 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.23 
 
 
1076 aa  594  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.25 
 
 
1034 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  34.46 
 
 
1066 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.18 
 
 
1034 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  35.63 
 
 
1075 aa  591  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.82 
 
 
1070 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  35.64 
 
 
1068 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  35.54 
 
 
1068 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  34.97 
 
 
1074 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.94 
 
 
1066 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  34.2 
 
 
1031 aa  588  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  35.54 
 
 
1068 aa  589  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.64 
 
 
1068 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.39 
 
 
1062 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  34.02 
 
 
1052 aa  581  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 
1054 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  33.46 
 
 
1050 aa  581  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  33.96 
 
 
1049 aa  577  1e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  36.12 
 
 
1032 aa  576  1e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 
1046 aa  577  1e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  34.91 
 
 
1034 aa  576  1e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  36.52 
 
 
1045 aa  578  1e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  35.06 
 
 
1077 aa  575  1e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  32.99 
 
 
1054 aa  574  1e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  33.14 
 
 
1064 aa  573  1e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  33.49 
 
 
1053 aa  575  1e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.65 
 
 
1062 aa  572  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  35.06 
 
 
1064 aa  572  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  36.28 
 
 
1038 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.55 
 
 
1028 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  33.17 
 
 
1048 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  32.77 
 
 
1070 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1466  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.96 
 
 
1042 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198687  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.68 
 
 
1049 aa  567  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  32.78 
 
 
1028 aa  565  1e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  32.14 
 
 
1070 aa  564  1e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  32.64 
 
 
1077 aa  565  1e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  32.64 
 
 
1077 aa  565  1e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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