45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1606 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  100 
 
 		 368 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  66.22 
 
 		 369 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  35.01 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  35.58 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  24.74 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  23.63 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  22.17 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  23.88 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  24.61 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  25.89 
 
 		 455 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  33.33 
 
 		 449 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  29.25 
 
 		 482 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  47.37 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  37 
 
 		 577 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  31.37 
 
 		 410 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  26.56 
 
 		 445 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  34.48 
 
 		 736 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  33.67 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  44.44 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  21.94 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  31.18 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  32.65 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  52.27 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  47.27 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  27.27 
 
 		 520 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  32.98 
 
 		 769 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  31 
 
 		 522 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  32 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.12 
 
 		 429 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  40.68 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  24.31 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  41.51 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  28.57 
 
 		 464 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  36.71 
 
 		 515 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  24.58 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  48.89 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 		 709 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  29.47 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  29.7 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  22.41 
 
 		 584 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.89 
 
 		 582 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  22.02 
 
 		 598 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  46.15 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  41.94 
 
 		 535 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  23.6 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>