More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1368 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  65.56 
 
 		 514 aa  649    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  100 
 
 		 525 aa  1060    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.33 
 
 		 519 aa  870    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.3 
 
 		 513 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.64 
 
 		 513 aa  552  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  42.23 
 
 		 527 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  31.97 
 
 		 500 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  35.89 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  35.94 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  35.94 
 
 		 500 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  35.94 
 
 		 500 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  35.74 
 
 		 500 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  35.74 
 
 		 500 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5098  sensory histidine kinase UhpB  35.7 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4033  sensory histidine kinase UhpB  35.43 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4251  sensory histidine kinase UhpB  35.7 
 
 		 497 aa  224  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3881  sensory histidine kinase UhpB  35.7 
 
 		 497 aa  224  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4176  sensory histidine kinase UhpB  35.7 
 
 		 497 aa  224  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03552  sensory histidine kinase in two-component regulatory sytem with UhpA  35.7 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0035  histidine kinase  35.7 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0031  sensory histidine kinase UhpB  35.7 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03494  hypothetical protein  35.7 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  35.03 
 
 		 505 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  31.23 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  31.03 
 
 		 509 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  31.03 
 
 		 509 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  30.04 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.29 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  33.73 
 
 		 1046 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.93 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 770 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 372 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1168 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.25 
 
 		 772 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.76 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 373 aa  107  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  28.17 
 
 		 683 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  35.14 
 
 		 216 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  32.14 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 775 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  33.61 
 
 		 521 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 485 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  35.1 
 
 		 430 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  31.96 
 
 		 830 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 382 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1168 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  29.12 
 
 		 325 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  30.82 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.3 
 
 		 515 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 553 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 385 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 395 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 573 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 407 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 370 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 408 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 439 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  32.29 
 
 		 343 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 560 aa  98.2  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  31.19 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 703 aa  98.2  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  28.9 
 
 		 459 aa  98.2  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 336 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  32.02 
 
 		 490 aa  97.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 474 aa  97.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.75 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 1229 aa  97.1  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  31.67 
 
 		 415 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  29.88 
 
 		 368 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 684 aa  96.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  33.2 
 
 		 478 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 1101 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 780 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  27.31 
 
 		 447 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 707 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 384 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  33.47 
 
 		 475 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 700 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0763  sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 763 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0673199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>