148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  593  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  98.64 
 
 
295 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  61.03 
 
 
293 aa  358  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  60.49 
 
 
404 aa  357  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  60.7 
 
 
395 aa  357  2e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  61.68 
 
 
444 aa  356  2e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  60.14 
 
 
404 aa  356  3e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  60.14 
 
 
404 aa  356  3e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  59.53 
 
 
486 aa  356  3e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  60.14 
 
 
404 aa  356  3e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  62.36 
 
 
395 aa  355  4e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  60.07 
 
 
295 aa  355  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  60.07 
 
 
295 aa  355  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  59.7 
 
 
295 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  1.47175e-08 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  60.9 
 
 
293 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  64.71 
 
 
299 aa  351  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  58.11 
 
 
294 aa  349  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  58.5 
 
 
291 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  60.52 
 
 
291 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  63.26 
 
 
291 aa  336  3e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  59.42 
 
 
287 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  57.78 
 
 
293 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  58.52 
 
 
317 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  57.45 
 
 
293 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  58.27 
 
 
317 aa  331  9e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  54.92 
 
 
291 aa  327  1e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  56.39 
 
 
303 aa  315  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  58.11 
 
 
292 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  50.88 
 
 
299 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  50.53 
 
 
299 aa  304  1e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  50.53 
 
 
299 aa  304  1e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  59.09 
 
 
296 aa  302  4e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
299 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  50.74 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  50.74 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  50.74 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  50.74 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  49.26 
 
 
307 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  49.66 
 
 
283 aa  282  4e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  45.15 
 
 
292 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 
298 aa  244  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  46.72 
 
 
293 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.76 
 
 
289 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 
288 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  40.07 
 
 
288 aa  215  6e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  37.33 
 
 
304 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  43.16 
 
 
293 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.68 
 
 
299 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 
266 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  38.52 
 
 
292 aa  164  1e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 
273 aa  164  2e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  33.96 
 
 
273 aa  163  4e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.46635e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  33.82 
 
 
293 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  32.66 
 
 
302 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  3.15394e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
342 aa  63.2  5e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  24.48 
 
 
301 aa  62.8  7e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 
278 aa  58.9  1e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.2 
 
 
319 aa  57.8  2e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
321 aa  57.8  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
312 aa  57.4  3e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 
332 aa  57  4e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 
325 aa  56.6  5e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  24.34 
 
 
274 aa  56.6  5e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
597 aa  54.7  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 
526 aa  54.7  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 
319 aa  54.3  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.57 
 
 
318 aa  53.5  5e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
264 aa  52.8  7e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  25.65 
 
 
316 aa  52.4  9e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
317 aa  52  1e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 
246 aa  52  1e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 
319 aa  52  1e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.56 
 
 
319 aa  51.6  2e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  51.2  2e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 
315 aa  51.6  2e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  25.48 
 
 
308 aa  51.2  2e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  51.2  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  51.2  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  51.2  2e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  51.2  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  24.55 
 
 
316 aa  51.2  2e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.99 
 
 
319 aa  51.2  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  51.2  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  51.2  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 
318 aa  51.2  2e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  21.69 
 
 
246 aa  50.8  3e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.25 
 
 
291 aa  50.8  3e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  1.02654e-05 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
337 aa  50.8  3e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 
347 aa  50.1  4e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  24.66 
 
 
299 aa  50.4  4e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.42 
 
 
318 aa  50.1  4e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
319 aa  50.1  5e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
319 aa  50.1  5e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 
312 aa  49.7  6e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
310 aa  49.7  6e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.93 
 
 
319 aa  49.7  6e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  1.47099e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
318 aa  49.3  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.78 
 
 
317 aa  48.9  9e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.55 
 
 
318 aa  48.9  9e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 
312 aa  48.9  9e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>