224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3075 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  674    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  85.67 
 
 		 334 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  82.57 
 
 		 334 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 363 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  29.19 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  29.19 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  29.19 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  29.19 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  29.19 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  29.15 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  25.74 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  27.96 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  27.12 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  29.29 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  28.21 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  30.59 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  28.39 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  28.71 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  25.16 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  28.39 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  28.39 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  29.74 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  28.2 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  28.01 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  28.2 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  28.2 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  28.2 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  28.06 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  27.72 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  27.72 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  27.39 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  29.19 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 		 319 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  27.69 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  27.69 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  28.85 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  27.99 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  28.85 
 
 		 694 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  28.57 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  25.8 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  25.8 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  26.86 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  30.79 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  29 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  29.68 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  27.12 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  29.24 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  27.01 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  26.58 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5338  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  28.24 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>