67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2506 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  29.03 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  23.48 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  29.03 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.82 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  32.37 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  29.84 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  29.11 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  29.03 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  29.11 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  29.11 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  29.29 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  29.61 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  28.65 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  29.29 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  29.29 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  28.48 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  28.09 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  25.47 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  36 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  29.89 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  29.56 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  28.03 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  32.18 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  29.95 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  30.85 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  26.4 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  25.93 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  29.9 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  28.65 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  26.07 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  26.4 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  27.62 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  29.71 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  23.35 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  26.4 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  26.05 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  30.51 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  26.6 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  30.22 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.71 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  26.6 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  29.78 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  25.84 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  24.55 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  26.64 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  29.3 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  28.18 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  29.61 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  24.39 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  27.68 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  29.73 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  33.66 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  22.67 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  29.59 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  26.15 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25.44 
 
 		 291 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25.44 
 
 		 291 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  29.58 
 
 		 249 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25.44 
 
 		 291 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  28.74 
 
 		 235 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>