More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2383 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  68.22 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  71.71 
 
 		 252 aa  362  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  69.11 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  68.87 
 
 		 250 aa  357  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  69.29 
 
 		 249 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  68.9 
 
 		 249 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  66.67 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  67.05 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  72.73 
 
 		 254 aa  352  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  69.26 
 
 		 249 aa  352  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  68.77 
 
 		 251 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  67.57 
 
 		 251 aa  351  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  67.95 
 
 		 251 aa  351  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  71.04 
 
 		 251 aa  349  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  67.95 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  68.09 
 
 		 249 aa  348  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  66.93 
 
 		 249 aa  348  7e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  67.05 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  68.34 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  67.05 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  70.66 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  67.05 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  64.59 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  65.76 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  66.93 
 
 		 252 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  66.93 
 
 		 248 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  66.41 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  64.98 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  63.57 
 
 		 251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  61.78 
 
 		 251 aa  323  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2304  hypothetical protein  61.78 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0897914  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2034  hypothetical protein  62.16 
 
 		 251 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  62.85 
 
 		 252 aa  311  9e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1665  protein of unknown function DUF28  62.65 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0741834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12910  conserved hypothetical protein TIGR01033  60 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.335721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  56.2 
 
 		 252 aa  262  4.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  56.59 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  48.64 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  45.91 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  45.91 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  45.59 
 
 		 247 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  45.74 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  44.83 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  45.35 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  48.25 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  44.96 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  44.57 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  46.12 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  44.96 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  46.83 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  45.95 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  47.24 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  48.45 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  45.95 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  45.7 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  47.22 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  42.35 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  42.69 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  45.21 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  44.84 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0323  protein of unknown function DUF28  44.02 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  44.14 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  44.19 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07020  conserved hypothetical protein TIGR01033  42.86 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000405153  normal  0.306564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  44.96 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  45.24 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  44.4 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  46.3 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  44.44 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  41.25 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0967  protein of unknown function DUF28  43.61 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.021533  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  44.22 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  44.23 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  46.64 
 
 		 245 aa  208  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  43.44 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  43.63 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  45 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  40.86 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  44.53 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  44.75 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  44.53 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  44.75 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  44.75 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  44.53 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  44.75 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  44.53 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  44.53 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  44.53 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  41.31 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  44.14 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  44.14 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  44.02 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  44.4 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  44.02 
 
 		 248 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  44.4 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  45.17 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  43.75 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  44.36 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03900  conserved hypothetical protein TIGR01033  43.18 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.144849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>