246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2712 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  620  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  32.99 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 252 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 261 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 261 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  30.56 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  30.77 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  30.56 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  29.86 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  33.72 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  29.15 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  28.62 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  48.62 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  28.62 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  28.62 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  28.62 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  28.62 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  28.62 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  28.62 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  31.54 
 
 		 265 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  28.27 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.75 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  29.18 
 
 		 260 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  28.27 
 
 		 249 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  34.46 
 
 		 271 aa  122  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  32.38 
 
 		 261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 249 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  27.56 
 
 		 249 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  27.56 
 
 		 249 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  34.09 
 
 		 268 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 253 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 265 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  27.21 
 
 		 249 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  27.37 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 243 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  28.47 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  32.32 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  31.14 
 
 		 272 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  31.25 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  39.67 
 
 		 239 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  28.75 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.75 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  28.46 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  31.09 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  25.77 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.08 
 
 		 262 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  37.29 
 
 		 278 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  37.07 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 236 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 274 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  38.05 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  27.1 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  27.92 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  38.05 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  33.56 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  28.94 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  29.2 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  37.39 
 
 		 242 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  27.41 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  27.41 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  34.19 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  31.62 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  31.62 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  32.39 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  33.02 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  33.02 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  28.76 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  33.9 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  33.02 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  37.86 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  33.04 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  31.53 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  32.08 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  30.96 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 377 aa  79  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  26.15 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  26.15 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  26.92 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  26.92 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>