More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4050 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
548 aa  1114    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 
534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.09 
 
 
516 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.26 
 
 
535 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 
532 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
527 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 
551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.87 
 
 
524 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
595 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 
517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.77 
 
 
521 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 
502 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.77 
 
 
521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.77 
 
 
521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.77 
 
 
521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
537 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 
551 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
537 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
546 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
556 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 
541 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
509 aa  157  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 
519 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 
544 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
522 aa  156  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
520 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.44 
 
 
520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 
503 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.21 
 
 
524 aa  153  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
517 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 
519 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
531 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.77 
 
 
512 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
607 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 
544 aa  150  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  27.92 
 
 
533 aa  149  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.57 
 
 
512 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.05 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 
542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.57 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.86 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.57 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.72 
 
 
541 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.57 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.57 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.41 
 
 
493 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 
516 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
516 aa  148  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
490 aa  147  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
512 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
520 aa  146  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
528 aa  146  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
544 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
501 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 
523 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
520 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
520 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
512 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  24.2 
 
 
551 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
520 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
555 aa  143  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
564 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.06 
 
 
550 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  24.79 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.24 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  25.2 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  25.49 
 
 
520 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  28.11 
 
 
556 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.51 
 
 
524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
520 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  25.89 
 
 
512 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
539 aa  140  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  25.89 
 
 
512 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  25.89 
 
 
512 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  25.89 
 
 
512 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  25.89 
 
 
512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  23.73 
 
 
550 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
540 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
506 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
530 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
511 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 
518 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  24.95 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  24.95 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.95 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
535 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  24.95 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.4 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  24.95 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  24.95 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  24.95 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
513 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  25.7 
 
 
553 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>