More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4111 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 288 aa  599  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  63.94 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  59.19 
 
 		 274 aa  349  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  54.95 
 
 		 286 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  57.86 
 
 		 289 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  55.15 
 
 		 278 aa  333  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  56 
 
 		 275 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 		 283 aa  324  8.000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  55.15 
 
 		 276 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  56.02 
 
 		 304 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  56.77 
 
 		 276 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  54.78 
 
 		 279 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  52.69 
 
 		 291 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  49.62 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 278 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  52.29 
 
 		 283 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  41.43 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  38.29 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  38.2 
 
 		 271 aa  208  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.8 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  34.57 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  32.58 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  38.49 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 279 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.27 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.11 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.11 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.11 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.11 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  31.11 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.11 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.68 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.99 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.84 
 
 		 369 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3771  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3844  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.91 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>