225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3827 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  74.4 
 
 		 174 aa  254  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  70.41 
 
 		 174 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  68.24 
 
 		 176 aa  244  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  69.82 
 
 		 174 aa  243  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  68.6 
 
 		 174 aa  240  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 174 aa  239  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  56.97 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  55.23 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  55.03 
 
 		 175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  55.88 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  51.32 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  53.85 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  38.6 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  40.74 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  33.92 
 
 		 175 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  34.32 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  30.51 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  33.52 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.4 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25.27 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  28.14 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  43.06 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  31.76 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  29.88 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  29.59 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  39.73 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  29.12 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  30.47 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  31.55 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  29.13 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.21 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  42.03 
 
 		 129 aa  51.2  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  28.78 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  22.35 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  38.96 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  32.91 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  31.25 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  29.84 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  32.09 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  31.46 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  28.02 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  27.65 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  27.03 
 
 		 325 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  37.5 
 
 		 252 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  30.25 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  22.11 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  19.89 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>