More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2864 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  524  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.23 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  55.51 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 279 aa  278  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  54.51 
 
 		 268 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  56.18 
 
 		 259 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.59 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.07 
 
 		 274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  55.28 
 
 		 254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  54.88 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  54.88 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  52.23 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 257 aa  248  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  47.58 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  56.4 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  47.45 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  52.44 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.4 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  48.8 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  46.99 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  38.46 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.5 
 
 		 321 aa  178  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  37.18 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  39.48 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  36.32 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.4 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.4 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  36.13 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  38.2 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  40 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  42.46 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  40.65 
 
 		 296 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.59 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  40 
 
 		 335 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  41.38 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 241 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  36.59 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.61 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  36.2 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  34.14 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  37.13 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.63 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  38.56 
 
 		 244 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  38.01 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  35.39 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  37.45 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.78 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  45.65 
 
 		 338 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  38.56 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  37.95 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  36.02 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.11 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  36.02 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 313 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.48 
 
 		 337 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  33.48 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  40.83 
 
 		 316 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  35.37 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  39.55 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  37.07 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  36.92 
 
 		 337 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4511  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0518  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 305 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  37.23 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.56 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  35.41 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.1 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  39.32 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  42.01 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  34.43 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 319 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.27 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 318 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>