More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0518 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0518  ABC transporter related protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  40.7 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  38.7 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  38.82 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  32.6 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  32.07 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  32.07 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  37.45 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  38.68 
 
 		 337 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  34.51 
 
 		 338 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  36.82 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  34.51 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  36.19 
 
 		 338 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  34.38 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  35.11 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.81 
 
 		 337 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  39.58 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24930  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.73 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  34.29 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.73 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  34.96 
 
 		 309 aa  148  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 305 aa  148  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  34.55 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  34.25 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  37.95 
 
 		 876 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  36.32 
 
 		 337 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.56 
 
 		 368 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  37.6 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3548  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.5 
 
 		 335 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 814 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  33.18 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  34.35 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  35.94 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  34.71 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  30.18 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.29 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  37.95 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.79 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.79 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  37.27 
 
 		 346 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  37.27 
 
 		 346 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  37.27 
 
 		 346 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  32.59 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  38.5 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  36.07 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  32.41 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  38.36 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.48 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  32.74 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  35.34 
 
 		 248 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40.1 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  32.74 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  38.32 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  32.72 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  28.4 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  33.91 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  37.12 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.38 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  38.05 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  33.47 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  29.41 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  34.15 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  33.33 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  34.93 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.09 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  32.74 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  37.27 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  31.6 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  37.27 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  37.27 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  37.27 
 
 		 318 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  32.3 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  33.33 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  32.74 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.61 
 
 		 335 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  32.3 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>