More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1757 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  100 
 
 		 306 aa  609  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  77.85 
 
 		 306 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  68.23 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  67.67 
 
 		 309 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  65.79 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  64.16 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  63.39 
 
 		 302 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  66.9 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  61.3 
 
 		 300 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  64.16 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  64.38 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  62.05 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  62.71 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  61.97 
 
 		 312 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  61.86 
 
 		 299 aa  354  8.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  60.98 
 
 		 308 aa  352  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  60.98 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.74 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  60.41 
 
 		 301 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  60.76 
 
 		 307 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  59.52 
 
 		 311 aa  345  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  61.28 
 
 		 313 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  61.28 
 
 		 313 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  61.28 
 
 		 313 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.84 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  60.07 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  61.11 
 
 		 302 aa  338  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  53.47 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  59.25 
 
 		 300 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  59.6 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  57.72 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  60.76 
 
 		 305 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  52.25 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  56.95 
 
 		 300 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.33 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  50.49 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.15 
 
 		 324 aa  291  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  57.01 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  47.1 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  47.1 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  46.76 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  47.65 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 304 aa  228  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  43.24 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  36.61 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  40.65 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  35.42 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.71 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  37.71 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.83 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  36.15 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  39.06 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.83 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.36 
 
 		 291 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  31.38 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  27.24 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40.21 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  30.88 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.75 
 
 		 332 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 256 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.41 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.77 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  35.56 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  31.74 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  34.56 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  38.63 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  36.96 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  36.54 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  42.13 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.11 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  39.13 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  34.13 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  35.76 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>