More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0014 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  64.32 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  63.87 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  60.91 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  60 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  57.61 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  61.57 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  58.33 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  59 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  58.85 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  56.15 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  51.43 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  49.18 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  47.72 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  50.4 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  49.17 
 
 		 243 aa  204  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  32.31 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  34.04 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  38.58 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  27.78 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  39.64 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  38.46 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  38.14 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  39.81 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.18 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  33.53 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  39.84 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  36.77 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  36.44 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  38.85 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  29.93 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  32.05 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  34.96 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  33.57 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.4 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  41.41 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.96 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  30.96 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  30.51 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  32.19 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.13 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  36.8 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  28.03 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  31.55 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  31.68 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  28.22 
 
 		 509 aa  62  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  34.16 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  41.35 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  35.96 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  37.61 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  33.68 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  29.45 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  29.45 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  29.66 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  29.45 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  27.81 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  27.63 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  29.14 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  29.45 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  29.45 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  29.45 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  28.77 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  28.77 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  27.49 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  30.18 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  28.77 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  33.07 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  28.38 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  31.97 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  28 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  29.5 
 
 		 508 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  28.24 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  29.71 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1684  anthranilate synthase component II  29.52 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  33.94 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0068  class I glutamine amidotransferase  23.84 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.919484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  31.47 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  32.41 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  36.75 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  29.51 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  36.73 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  30.41 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  31.54 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  32.62 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>