More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0094 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  39.06 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.13 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  35.5 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  35.86 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  35.05 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  34.32 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  34.63 
 
 		 310 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  32.9 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  34.67 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  34.2 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  35 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  35 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  33 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  32.33 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.67 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  33.01 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  33.76 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  32.25 
 
 		 359 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  31.33 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  33.76 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  32.45 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  33.66 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  34.65 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1712  methionyl-tRNA formyltransferase  33.97 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  31.95 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  35.48 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  34.3 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  33.78 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  35.88 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  33.78 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  33.78 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  32.14 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  33.78 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  33.78 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  33.78 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  32.23 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  32.56 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  33.01 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  32.24 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  32.33 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  30.46 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  31.44 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0012  methionyl-tRNA formyltransferase  33.97 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  32.33 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.61 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  37.89 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  32.33 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  31.49 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  29.75 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  35.83 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  32.12 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4081  methionyl-tRNA formyltransferase  32.51 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  32.12 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  30.18 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  34.73 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  34.92 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  33.11 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  31.44 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  31.44 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  31.73 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  29.66 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  31.44 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  31.82 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  32.89 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  32.11 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  31.33 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  32.57 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  31.85 
 
 		 323 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  31.7 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  32.78 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  32.78 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  32.78 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>