More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1465 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
580 aa  1147    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  44.5 
 
 
598 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  41.3 
 
 
606 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.14 
 
 
754 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  42.91 
 
 
586 aa  411  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  39.77 
 
 
602 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.97 
 
 
612 aa  375  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  42.66 
 
 
605 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  40.34 
 
 
625 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  40.03 
 
 
582 aa  365  1e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  46.59 
 
 
462 aa  364  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  37.12 
 
 
603 aa  360  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.29 
 
 
588 aa  354  2e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.28 
 
 
612 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  40.08 
 
 
651 aa  336  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  38.23 
 
 
605 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  36.55 
 
 
605 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.48 
 
 
603 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.01 
 
 
582 aa  293  5e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  38.13 
 
 
605 aa  292  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  38.41 
 
 
457 aa  289  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  40.95 
 
 
544 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  33.56 
 
 
615 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.59 
 
 
582 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  33.54 
 
 
613 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  41.04 
 
 
453 aa  242  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31.27 
 
 
669 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.39 
 
 
608 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.15 
 
 
614 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  34.72 
 
 
626 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.99 
 
 
587 aa  223  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.44 
 
 
577 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  32.36 
 
 
627 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  34.31 
 
 
470 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  30.34 
 
 
631 aa  213  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  33.72 
 
 
590 aa  210  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.86 
 
 
600 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  36.38 
 
 
638 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  36.8 
 
 
612 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  36.54 
 
 
634 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  33.03 
 
 
593 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  35.62 
 
 
402 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  37.09 
 
 
492 aa  204  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.24 
 
 
584 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  30.56 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  30.88 
 
 
467 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  33.88 
 
 
429 aa  200  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.89 
 
 
569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  30.53 
 
 
627 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  35.5 
 
 
650 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.06 
 
 
591 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.66 
 
 
620 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.31 
 
 
859 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  30.7 
 
 
624 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.65 
 
 
591 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.17 
 
 
628 aa  187  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.19 
 
 
613 aa  187  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  30.55 
 
 
597 aa  187  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.41 
 
 
594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.81 
 
 
863 aa  184  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.41 
 
 
428 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.44 
 
 
591 aa  181  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.59 
 
 
456 aa  180  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.5 
 
 
577 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.2 
 
 
598 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.77 
 
 
862 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
589 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.61 
 
 
579 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.61 
 
 
579 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.61 
 
 
579 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.61 
 
 
636 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.61 
 
 
628 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  25.79 
 
 
579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.97 
 
 
593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.23 
 
 
863 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.97 
 
 
593 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  27.69 
 
 
629 aa  163  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.32 
 
 
605 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  27.3 
 
 
606 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  25.17 
 
 
640 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.68 
 
 
589 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.15 
 
 
589 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.15 
 
 
589 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  27.7 
 
 
605 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  28.92 
 
 
595 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.54 
 
 
585 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  28.49 
 
 
603 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2181  Cl- channel voltage-gated family protein  28.09 
 
 
634 aa  157  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.46 
 
 
575 aa  157  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.48 
 
 
598 aa  157  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.9 
 
 
481 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  27.71 
 
 
590 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  33.51 
 
 
455 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.2 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  27.4 
 
 
596 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  29.81 
 
 
859 aa  154  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  30.16 
 
 
585 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  33.24 
 
 
455 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2552  Chloride channel core  33.84 
 
 
531 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  28.72 
 
 
897 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>