More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2552 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2552  Chloride channel core  100 
 
 
531 aa  1007    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  39.59 
 
 
598 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  35.06 
 
 
462 aa  229  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  35.34 
 
 
586 aa  219  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  42.19 
 
 
453 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  39.6 
 
 
492 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.7 
 
 
754 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.84 
 
 
580 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  31.97 
 
 
457 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  34.74 
 
 
606 aa  183  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.6 
 
 
582 aa  183  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  34.38 
 
 
582 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  31.72 
 
 
602 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  33.7 
 
 
625 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.43 
 
 
612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  34.2 
 
 
603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.48 
 
 
588 aa  163  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  27.8 
 
 
467 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  27.8 
 
 
474 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  33.49 
 
 
651 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  34.77 
 
 
605 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.21 
 
 
612 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.86 
 
 
614 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  33.92 
 
 
605 aa  146  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.54 
 
 
613 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  29.32 
 
 
470 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.33 
 
 
603 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  33.33 
 
 
605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.23 
 
 
587 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.61 
 
 
582 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.14 
 
 
669 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  36.58 
 
 
650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  33.88 
 
 
608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.17 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.19 
 
 
615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  27.82 
 
 
544 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.26 
 
 
600 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  36.9 
 
 
638 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.19 
 
 
598 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  27.99 
 
 
543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.87 
 
 
584 aa  116  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  30.31 
 
 
629 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.11 
 
 
613 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.68 
 
 
589 aa  114  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  29.82 
 
 
533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  28.06 
 
 
617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  36.21 
 
 
634 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  32.77 
 
 
605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.56 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  32.85 
 
 
402 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  30.39 
 
 
627 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  38.82 
 
 
612 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.65 
 
 
426 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  25.81 
 
 
585 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.79 
 
 
560 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 
589 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.71 
 
 
569 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 
589 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 
589 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.33 
 
 
631 aa  106  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.95 
 
 
575 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.7 
 
 
626 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  31.36 
 
 
595 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  31.36 
 
 
595 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.36 
 
 
595 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  31.6 
 
 
595 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.48 
 
 
471 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  28.78 
 
 
429 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  30 
 
 
481 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.63 
 
 
593 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.3 
 
 
591 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.11 
 
 
595 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.22 
 
 
620 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.4 
 
 
601 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.05 
 
 
593 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  31.11 
 
 
595 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  30.86 
 
 
595 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  28.54 
 
 
475 aa  100  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.12 
 
 
577 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.48 
 
 
473 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  31.27 
 
 
640 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.77 
 
 
526 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
426 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.26 
 
 
473 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.26 
 
 
473 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.26 
 
 
473 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.26 
 
 
473 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  26.19 
 
 
494 aa  98.6  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.29 
 
 
456 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.61 
 
 
636 aa  97.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.61 
 
 
579 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.61 
 
 
579 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  29.91 
 
 
605 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.61 
 
 
579 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  28.99 
 
 
633 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.46 
 
 
603 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  27.22 
 
 
579 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  31.78 
 
 
605 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.65 
 
 
594 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  27.92 
 
 
603 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>