More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0502 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  754    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  30.15 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  25.82 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  25.71 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  26.65 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 438 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 383 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.33 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.42 
 
 		 440 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  28.17 
 
 		 405 aa  96.3  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 425 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.14 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  25.21 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 422 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  27.81 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.74 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.4 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.4 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 418 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  27.47 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.74 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  27.27 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.98 
 
 		 424 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  25.5 
 
 		 430 aa  90.1  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 393 aa  89.7  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  30.89 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.18 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.07 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2302  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  31.72 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  28.18 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.91 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.65 
 
 		 394 aa  86.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.12 
 
 		 400 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  25.67 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.85 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  27.87 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  28 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>