142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0186 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  100 
 
 
179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  40.57 
 
 
186 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  41.62 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.46 
 
 
160 aa  92.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  32.93 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  34.71 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  31.33 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  30.12 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  30.72 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.4 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  39.86 
 
 
151 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  37.65 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.31 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.81 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.93 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  35.95 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.78 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  35.42 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.72 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  34.72 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.19 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  32.64 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  36.97 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  34.25 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.91 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.34 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.54 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.26 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.05 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  34.46 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.39 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  31.94 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  34.31 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  32.3 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  34.72 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  34.72 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  34.72 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  34.48 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.49 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  28.39 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.03 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.05 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.22 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.87 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  33.54 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.83 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  32 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  32.08 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.52 
 
 
161 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  30.12 
 
 
162 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  29.3 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  29.3 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  31.39 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  34.33 
 
 
155 aa  61.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.2 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.2 
 
 
173 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.31 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  29.53 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.87 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.71 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  33.91 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  28.47 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.73 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  29.86 
 
 
190 aa  55.1  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.55 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  33.08 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.14 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  34.67 
 
 
148 aa  54.7  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.03 
 
 
196 aa  54.3  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.58 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.63 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  33.08 
 
 
188 aa  52.4  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  25.79 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.6 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  34.82 
 
 
166 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  28.77 
 
 
154 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  31.72 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  32.14 
 
 
203 aa  51.6  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  30.52 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  29.41 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  29.49 
 
 
188 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.3 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  28.26 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  27.82 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  28.1 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  26.88 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  28.09 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  29.5 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  28.15 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
154 aa  48.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
154 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  29.14 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>