257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0471 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  83.17 
 
 
626 aa  1088    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  73.32 
 
 
601 aa  888    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0471  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  100 
 
 
625 aa  1285    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1907  Pyrrolo-quinoline quinone  81.83 
 
 
624 aa  1040    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135977  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2044  Pyrrolo-quinoline quinone  64.73 
 
 
599 aa  805    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.115508  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  84.88 
 
 
629 aa  1082    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  82.85 
 
 
626 aa  1086    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2993  Pyrrolo-quinoline quinone  74.72 
 
 
632 aa  997    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.391865  normal  0.445791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  71.43 
 
 
620 aa  864    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4210  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  83.63 
 
 
627 aa  1099    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719388  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  83.17 
 
 
626 aa  1088    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  49.19 
 
 
601 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  50.32 
 
 
601 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  47.89 
 
 
606 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  48.92 
 
 
600 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  49.09 
 
 
600 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  48.68 
 
 
600 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  49.41 
 
 
601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  46.69 
 
 
605 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  48.82 
 
 
599 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  48.91 
 
 
600 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  47.86 
 
 
623 aa  558  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5752  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  48.26 
 
 
599 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0649397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5977  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  48.43 
 
 
600 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.391325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  48.53 
 
 
601 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  47.5 
 
 
600 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1809  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  48.73 
 
 
601 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  48.01 
 
 
606 aa  552  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2145  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  48.73 
 
 
601 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.885263  normal  0.307838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  46.74 
 
 
608 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0508  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  49.3 
 
 
601 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619983  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1761  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  48.7 
 
 
601 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  47.16 
 
 
607 aa  548  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  46.17 
 
 
619 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  49.48 
 
 
608 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  46.51 
 
 
606 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1717  Pyrrolo-quinoline quinone  44.37 
 
 
620 aa  524  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000584084  unclonable  0.000000429175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2314  Pyrrolo-quinoline quinone  43.75 
 
 
625 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000100555  unclonable  0.000000320672 
 
 
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.17 
 
 
590 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  45.99 
 
 
592 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  44.03 
 
 
615 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  46.17 
 
 
588 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  47.16 
 
 
604 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  44.21 
 
 
601 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  46.3 
 
 
616 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  43.54 
 
 
601 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  44.54 
 
 
613 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  42.63 
 
 
613 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  44.46 
 
 
611 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  42.03 
 
 
605 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3149  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  40.06 
 
 
631 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.71 
 
 
602 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  36.13 
 
 
554 aa  313  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  35.76 
 
 
580 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.45 
 
 
584 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.27 
 
 
584 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.97 
 
 
589 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.16 
 
 
587 aa  301  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.16 
 
 
587 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.79 
 
 
595 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.39 
 
 
587 aa  300  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  37.28 
 
 
579 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  34.27 
 
 
595 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  34.09 
 
 
595 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.62 
 
 
588 aa  296  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  34.15 
 
 
587 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  32.96 
 
 
580 aa  293  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  34.79 
 
 
620 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.26 
 
 
724 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  33.51 
 
 
591 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.06 
 
 
582 aa  290  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.37 
 
 
726 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  35.19 
 
 
593 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.29 
 
 
707 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  33.88 
 
 
602 aa  287  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.84 
 
 
597 aa  286  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.58 
 
 
579 aa  286  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  35.68 
 
 
726 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  34.39 
 
 
738 aa  286  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  33.77 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  36.4 
 
 
730 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.22 
 
 
697 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.15 
 
 
631 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  35.05 
 
 
702 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  34.62 
 
 
706 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  33.39 
 
 
587 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  35.14 
 
 
718 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  35.29 
 
 
721 aa  277  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  34.26 
 
 
570 aa  276  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  34.8 
 
 
631 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  34.8 
 
 
631 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  36.46 
 
 
727 aa  276  7e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.31 
 
 
576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  34.32 
 
 
718 aa  273  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  33.22 
 
 
720 aa  270  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  33.4 
 
 
573 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  33.4 
 
 
573 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  33.45 
 
 
580 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>