More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0576 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0576  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  720    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.391769  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1097  Fmu (Sun) domain protein  36.77 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1390  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.25 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.122511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.15 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2219  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.43 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0909  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.27 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.86309  normal  0.369802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0762  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.27 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.644908  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  32.33 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2001  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.5 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.41 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  28.41 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  29.08 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.33 
 
 		 444 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  31.29 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  28.1 
 
 		 442 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  30.3 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.57 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  26.96 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  27.14 
 
 		 435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  27.14 
 
 		 435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  32.58 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  29 
 
 		 453 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  31.68 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  28.19 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  29.84 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  29 
 
 		 453 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  29.23 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  29.08 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.23 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.2 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  28.09 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0394  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.92 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0312752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  29.15 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  27.48 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  28.72 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  29.17 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  28.14 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  29.76 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  29.48 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  28.96 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  28.66 
 
 		 695 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  27.42 
 
 		 446 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  28.52 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  28.97 
 
 		 438 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  26.97 
 
 		 519 aa  106  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  29.76 
 
 		 438 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.47 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  28.03 
 
 		 425 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  29.59 
 
 		 451 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  29.48 
 
 		 448 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0768  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.79 
 
 		 443 aa  105  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.534408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.03 
 
 		 425 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  29.76 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  30.59 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  26.33 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.3 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  29.17 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  29.28 
 
 		 451 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  25.57 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  28.06 
 
 		 452 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  28.16 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.86 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  28.28 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  29.47 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  27.06 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  29.72 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  27.8 
 
 		 448 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1498  NusB/RsmB/TIM44  29.41 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.791703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  32.27 
 
 		 460 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.46 
 
 		 426 aa  102  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  27.67 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  29.08 
 
 		 625 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.15 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  28.43 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  28.63 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  28.12 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  28.52 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.18 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  28.16 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.69 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  26.13 
 
 		 423 aa  99.8  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.91 
 
 		 437 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  29.47 
 
 		 460 aa  99.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  29.83 
 
 		 432 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  26.71 
 
 		 447 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  26.51 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.26 
 
 		 478 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  25.78 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  29.07 
 
 		 429 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.58 
 
 		 499 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  25.93 
 
 		 503 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.67 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  27.21 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.44 
 
 		 535 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  27.68 
 
 		 467 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  28.35 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  25.54 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  26.06 
 
 		 420 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  28.57 
 
 		 451 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  27.78 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>