More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1498 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1498  NusB/RsmB/TIM44  100 
 
 		 427 aa  831    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.791703 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  28.44 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  35.51 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  31.75 
 
 		 431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  30.96 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  30.77 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  30.96 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  30.96 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  37.1 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.95 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.71 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.04 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  33.26 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26.96 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26.96 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.67 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  31.63 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  33.18 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  30.11 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2626  sun protein  34.64 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  35.1 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  31.18 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.57 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.89 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.77 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  38.37 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  29.07 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.09 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  30.28 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  29.37 
 
 		 425 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  30.56 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.88 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  30.56 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  29.52 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.03 
 
 		 459 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  34.58 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.54 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  30.32 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  29.07 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  30.32 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  26.24 
 
 		 442 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  30.32 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.86 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  29.71 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  28.37 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  36.95 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  28.64 
 
 		 452 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  29.93 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  28.14 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  32.82 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  32.3 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  32.2 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  28.14 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.59 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  28.14 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.08 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  36.15 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  28.14 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  26.46 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  30.07 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  29.71 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.59 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  33.41 
 
 		 457 aa  150  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.96 
 
 		 422 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  30.1 
 
 		 428 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  31.97 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  28.38 
 
 		 444 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  28.37 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  28.57 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  28.31 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  29.47 
 
 		 429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  31.71 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  31.3 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  34.22 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.87 
 
 		 535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  29 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.46 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  28.47 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  32 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.03 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  29 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.35 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  30.45 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  28.64 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  30.4 
 
 		 448 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  32.12 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  31.76 
 
 		 446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  30.52 
 
 		 447 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  30.73 
 
 		 434 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  29.98 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  27.03 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  32.58 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  28.77 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  32.86 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  29.15 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  32.96 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  27.11 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.99 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.03 
 
 		 456 aa  143  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  28.96 
 
 		 444 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>