More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0448 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  100 
 
 
439 aa  832    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  78.49 
 
 
455 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  78.49 
 
 
455 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  78.03 
 
 
455 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  41.57 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  41.57 
 
 
448 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  39.24 
 
 
451 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37.83 
 
 
448 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  41.14 
 
 
452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.34 
 
 
453 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  39.96 
 
 
457 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.7 
 
 
452 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  36.85 
 
 
448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  36.63 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  38.29 
 
 
452 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  39.48 
 
 
501 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.89 
 
 
443 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.81 
 
 
452 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  36.36 
 
 
449 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  38.84 
 
 
464 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  33.56 
 
 
444 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  33.33 
 
 
453 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  33.7 
 
 
444 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  36.08 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.35 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  33.04 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.11 
 
 
442 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.62 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  30.67 
 
 
442 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  36.14 
 
 
451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  30.13 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  35.46 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  28.44 
 
 
435 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.43 
 
 
449 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  31.61 
 
 
451 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26.8 
 
 
435 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26.8 
 
 
435 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  31.92 
 
 
451 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  37 
 
 
451 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  34.08 
 
 
453 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.22 
 
 
455 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  31.5 
 
 
447 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  30.68 
 
 
440 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.22 
 
 
455 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  41.22 
 
 
455 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.83 
 
 
443 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  34.54 
 
 
442 aa  195  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  37.47 
 
 
432 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  27.79 
 
 
462 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  28.54 
 
 
444 aa  190  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  39.74 
 
 
484 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.51 
 
 
446 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.96 
 
 
438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.8 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  42 
 
 
449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  39.35 
 
 
494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  36.67 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.17 
 
 
509 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  31.13 
 
 
432 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.75 
 
 
495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  33.49 
 
 
445 aa  180  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  28.92 
 
 
437 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  29.7 
 
 
438 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  28.76 
 
 
438 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.8 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  31.59 
 
 
431 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  31.29 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.86 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  29.57 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  28.48 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.96 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  31.27 
 
 
431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  38.73 
 
 
452 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  39.91 
 
 
471 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.67 
 
 
438 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.01 
 
 
445 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  34.58 
 
 
448 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  35.43 
 
 
476 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  35.82 
 
 
505 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  29.67 
 
 
448 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  29.61 
 
 
451 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  29.61 
 
 
456 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  37.5 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  38.24 
 
 
489 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  32.29 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.78 
 
 
427 aa  166  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  27.31 
 
 
453 aa  166  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  36.27 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  35.19 
 
 
517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.98 
 
 
444 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
429 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.99 
 
 
450 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>