More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0394 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0394  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
398 aa  820    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0312752  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  44.76 
 
 
376 aa  323  3e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0007  PUA domain-containing protein  46.34 
 
 
375 aa  317  2e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0010  PUA domain-containing protein  43.54 
 
 
377 aa  317  2e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2171  PUA domain-containing protein  46.34 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0494  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.98 
 
 
389 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.201395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1346  Fmu (Sun) domain protein  40.11 
 
 
350 aa  247  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1617  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.88 
 
 
346 aa  222  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  36.52 
 
 
449 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  36.16 
 
 
451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  35.71 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  36.17 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.96 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.09 
 
 
452 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.62 
 
 
339 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  33.77 
 
 
443 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  36.54 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  33.63 
 
 
455 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.75 
 
 
449 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.55 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.48 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  34.5 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  35.35 
 
 
448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  33.33 
 
 
438 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.88 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  34.1 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  33.33 
 
 
438 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  31.92 
 
 
336 aa  119  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.63 
 
 
446 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  31.74 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  34.86 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  34.65 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  36.41 
 
 
430 aa  116  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.86 
 
 
442 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  35.46 
 
 
448 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  33.63 
 
 
453 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.65 
 
 
445 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.59 
 
 
464 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  31.28 
 
 
462 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  34.07 
 
 
444 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47176  predicted protein  29.93 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0576  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.92 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.391769  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  33.21 
 
 
457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  36 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  29.23 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  37.95 
 
 
471 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  32.14 
 
 
447 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.95 
 
 
448 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  31.25 
 
 
444 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  33.05 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.14 
 
 
454 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.33 
 
 
429 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  36.93 
 
 
445 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.33 
 
 
499 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  39.74 
 
 
447 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  40.88 
 
 
444 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.35 
 
 
302 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  32.6 
 
 
452 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  35.37 
 
 
452 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  37.06 
 
 
445 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  39.74 
 
 
449 aa  106  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  29.34 
 
 
427 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  28.83 
 
 
305 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  36.36 
 
 
450 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.21 
 
 
302 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  28.45 
 
 
528 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  34.5 
 
 
460 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.88 
 
 
302 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.5 
 
 
404 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  32.75 
 
 
453 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.7 
 
 
454 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  27.78 
 
 
440 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  32.08 
 
 
695 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  33.33 
 
 
460 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.96 
 
 
462 aa  104  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  32.39 
 
 
451 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  29.05 
 
 
427 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  30.43 
 
 
440 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  35.93 
 
 
451 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  30.98 
 
 
453 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  26.36 
 
 
426 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  30.95 
 
 
429 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  29.25 
 
 
439 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  32.28 
 
 
437 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.53 
 
 
482 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.75 
 
 
458 aa  102  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  32.03 
 
 
444 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1457  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  29.36 
 
 
335 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.33 
 
 
436 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  30.5 
 
 
431 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  36.75 
 
 
453 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  28.24 
 
 
428 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.98 
 
 
513 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  27.67 
 
 
428 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.98 
 
 
479 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  29.32 
 
 
434 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  26.49 
 
 
425 aa  99.8  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  31.98 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.98 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  27.67 
 
 
429 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>