More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0058 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  51.91 
 
 		 186 aa  193  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  36.87 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  35.56 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  35.56 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.99 
 
 		 211 aa  99  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  31.11 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  33.75 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  36.21 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  36.21 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  36.21 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  35.63 
 
 		 199 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  35.63 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  35.63 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  35.63 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  33.14 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00279  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  32.97 
 
 		 360 aa  94  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.56 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  32.96 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  35.06 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  32.76 
 
 		 199 aa  91.3  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.33 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  35.12 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.33 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  33.91 
 
 		 199 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  28.65 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  31.18 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  35.88 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  32.68 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  37.16 
 
 		 228 aa  87.8  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  36.69 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  34.23 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  34.24 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  31.15 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  38.06 
 
 		 341 aa  84.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  34.66 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  32.57 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  29.67 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  36.55 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  27.27 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  32.54 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  31.32 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  33.73 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  37.31 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.76 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4712  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  38.13 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0865771  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  34.86 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.76 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  33.33 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  35.86 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  33.53 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.16 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.16 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.16 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.16 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.16 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0151  hypothetical protein  34.75 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  36.3 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2508  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.98 
 
 		 394 aa  78.2  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  31.9 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  32.64 
 
 		 357 aa  78.2  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  34.51 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.58 
 
 		 343 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  39.39 
 
 		 320 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  31.61 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.54 
 
 		 342 aa  77.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  37.68 
 
 		 332 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.58 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.58 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.21 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.58 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  26.92 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  31.58 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0079  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.76 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.86 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.58 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.6 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  30.9 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  35.1 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  33.93 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2574  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C (16S rRNA m2G120 methyltransferase)  32.75 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.661981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  28.09 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  28.09 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.09 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  28.09 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.09 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3376  methyltransferase family protein  28.41 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  28.09 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3520  methyltransferase family protein  28.09 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.98 
 
 		 343 aa  75.1  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.41 
 
 		 331 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.99 
 
 		 343 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.99 
 
 		 343 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  27.84 
 
 		 378 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  30.51 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  34.53 
 
 		 331 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3411  methyltransferase family protein  27.81 
 
 		 378 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3577  methyltransferase family protein  27.81 
 
 		 378 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.227162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3515  methyltransferase family protein  27.81 
 
 		 378 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000598825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>