More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2579 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 479 aa  981    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  80.17 
 
 		 476 aa  796    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 492 aa  442  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 494 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 489 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 505 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 503 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 514 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 492 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 490 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  42.92 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 506 aa  375  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 487 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 491 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 485 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 484 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 495 aa  355  7.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 507 aa  349  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 493 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 496 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 516 aa  346  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 502 aa  336  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 491 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 467 aa  336  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 475 aa  332  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 467 aa  329  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 511 aa  329  8e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 491 aa  326  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 485 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 476 aa  323  4e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 463 aa  323  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 464 aa  322  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 469 aa  322  8e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 490 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 474 aa  319  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>