More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4922 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  66.94 
 
 
253 aa  353  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.9 
 
 
253 aa  340  9e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.9 
 
 
253 aa  340  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  68.13 
 
 
255 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3810  ABC transporter related  64.49 
 
 
253 aa  339  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  65.71 
 
 
253 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  69.39 
 
 
252 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4165  ABC transporter related  64.9 
 
 
253 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3154  ABC transporter related  69.39 
 
 
252 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  69.39 
 
 
252 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  68.57 
 
 
253 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2525  ABC transporter related  65.13 
 
 
268 aa  324  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  66.27 
 
 
255 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  65.08 
 
 
257 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 
244 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 
244 aa  275  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.84 
 
 
244 aa  274  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 
244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.84 
 
 
244 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.84 
 
 
244 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  58.68 
 
 
263 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 
244 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  53.06 
 
 
253 aa  260  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  49.39 
 
 
243 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  49.39 
 
 
243 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
250 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  51.22 
 
 
253 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.23 
 
 
250 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  50.81 
 
 
248 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.23 
 
 
250 aa  256  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  51.02 
 
 
253 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.23 
 
 
250 aa  256  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  53.01 
 
 
252 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.23 
 
 
250 aa  255  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.82 
 
 
250 aa  255  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.82 
 
 
250 aa  254  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  51.22 
 
 
241 aa  254  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  48.97 
 
 
247 aa  254  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.81 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.96 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 
244 aa  253  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.8 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  51.61 
 
 
251 aa  251  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  54.03 
 
 
271 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
244 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.41 
 
 
250 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  48.57 
 
 
245 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  50.6 
 
 
263 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.41 
 
 
250 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 
245 aa  249  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.41 
 
 
250 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.41 
 
 
250 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
243 aa  248  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.55 
 
 
252 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  52.03 
 
 
247 aa  247  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  52.03 
 
 
243 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  49.38 
 
 
247 aa  246  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.55 
 
 
252 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.2 
 
 
250 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.55 
 
 
252 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  47.15 
 
 
240 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 
245 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.4 
 
 
252 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.01 
 
 
250 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  48.37 
 
 
240 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  53.72 
 
 
248 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  51.78 
 
 
257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  44.72 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  48.37 
 
 
241 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  48.37 
 
 
241 aa  245  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  48.37 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  47.35 
 
 
245 aa  244  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
253 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.79 
 
 
278 aa  244  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  47.97 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  49.19 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0779  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.78 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.78 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  49.19 
 
 
241 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  49.19 
 
 
241 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  45.31 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  51.22 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  45.31 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  51.84 
 
 
262 aa  242  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  52.03 
 
 
251 aa  242  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50 
 
 
247 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  51.02 
 
 
253 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  49.19 
 
 
241 aa  241  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50 
 
 
247 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  52.4 
 
 
267 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.15 
 
 
244 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>