270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0549 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  83.22 
 
 		 442 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  100 
 
 		 450 aa  868    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  83 
 
 		 442 aa  696    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  73.18 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  68.84 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  72.39 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  34.56 
 
 		 420 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  31.94 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  33.84 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  35.81 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  35.99 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.18 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  34.51 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  36.05 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  32.23 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  35.81 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  31.37 
 
 		 485 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  32.29 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  33.87 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  34.02 
 
 		 419 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  33.33 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.16 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  26.94 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  32.26 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 504 aa  127  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  30.86 
 
 		 409 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  36.83 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  34.63 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.67 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  33.02 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  33.64 
 
 		 422 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  33.59 
 
 		 476 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  29.71 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  32.87 
 
 		 419 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  29.41 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  34.57 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  30.02 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  29.66 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  29.32 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  29.17 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.85 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  31.61 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  30.34 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  28.44 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  29.02 
 
 		 430 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  29.97 
 
 		 657 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  30.26 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  29.1 
 
 		 468 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  26.9 
 
 		 1199 aa  93.6  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  29.62 
 
 		 463 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  29.85 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  27.35 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  35.82 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  32.63 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.2 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  25.2 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  26.86 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  26.12 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  32.33 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  30.69 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  29.98 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  23.88 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  30.79 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  30.96 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  24.95 
 
 		 600 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  22.24 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  27.27 
 
 		 498 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  27.27 
 
 		 498 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  58.18 
 
 		 537 aa  67  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  33.06 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  46.32 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  46.32 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  60.34 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  56.36 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  29.26 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.2 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  30.38 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  28.87 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  48.21 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.06 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  28.11 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  33.57 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25.28 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  44.16 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  53.45 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  57.14 
 
 		 459 aa  57  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  26.91 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  26.91 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  51.56 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.45 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  52.11 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  27.41 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  23.35 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  45.98 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  50.91 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  49.12 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  52.63 
 
 		 543 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  62.22 
 
 		 469 aa  53.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>