More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3647 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  634    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  53.29 
 
 		 312 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  41.99 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  41.99 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  41.78 
 
 		 329 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  40.19 
 
 		 330 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  42.07 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  40.51 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  42.63 
 
 		 319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  44.09 
 
 		 328 aa  221  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  39.67 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  39.67 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  39.67 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  38.19 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  39.43 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  39.43 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  39.43 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  39.43 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  39.43 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  39.43 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  39.43 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  38.73 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  36.39 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  35.71 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  39.8 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  37.33 
 
 		 324 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  39.24 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  39.92 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  34.8 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  36.39 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  34.01 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  35.08 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  41.88 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  35.08 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  35.08 
 
 		 348 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  35.08 
 
 		 348 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  35.08 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  32.66 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  42.41 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  35.71 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  34.8 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  34.46 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  34.46 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  34.46 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  34.46 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  34.46 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  34.46 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  34.47 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  33.89 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  32.99 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  29.79 
 
 		 199 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  39.39 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  31.75 
 
 		 185 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  35.77 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  33.52 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  27.12 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  34.01 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  32.57 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  31.87 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  32.31 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  31.63 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  29.63 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  31.39 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.94 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.31 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.94 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.94 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  31.44 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.79 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.59 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  29.56 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  31.65 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.65 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.13 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  29.84 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  31.39 
 
 		 220 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.39 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  32.45 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  31.43 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26.85 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  29.94 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  32.45 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  28.07 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  31.36 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>