More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2424 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  243  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 118 aa  177  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  47.76 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  43.06 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  29.81 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  33.01 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  31.46 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  36.26 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  36.26 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  30.12 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>