More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0265 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  68.52 
 
 		 869 aa  1161    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  44.13 
 
 		 869 aa  679    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  47.32 
 
 		 851 aa  666    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  67.6 
 
 		 877 aa  1143    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  68.52 
 
 		 869 aa  1161    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  63.82 
 
 		 920 aa  1099    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  68.52 
 
 		 869 aa  1161    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  62.28 
 
 		 839 aa  1055    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  68.13 
 
 		 865 aa  1164    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  68.52 
 
 		 869 aa  1161    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  67.4 
 
 		 896 aa  1132    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  70.9 
 
 		 981 aa  1256    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  68.52 
 
 		 869 aa  1161    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  67.89 
 
 		 920 aa  1219    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  68.25 
 
 		 865 aa  1164    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  68.63 
 
 		 876 aa  1168    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  59.06 
 
 		 846 aa  1004    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  68.35 
 
 		 891 aa  1162    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  68.52 
 
 		 869 aa  1161    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  68.44 
 
 		 1002 aa  1243    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  69.07 
 
 		 992 aa  1219    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  67.93 
 
 		 888 aa  1158    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  76.83 
 
 		 876 aa  1360    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  68.24 
 
 		 891 aa  1142    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  68.51 
 
 		 876 aa  1167    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 879 aa  1813    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  68.13 
 
 		 865 aa  1163    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  69.19 
 
 		 865 aa  1176    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  71.02 
 
 		 981 aa  1268    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  71.07 
 
 		 980 aa  1256    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  48.28 
 
 		 939 aa  754    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  67.81 
 
 		 889 aa  1156    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  68.25 
 
 		 865 aa  1165    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  64.56 
 
 		 876 aa  1103    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  68.13 
 
 		 865 aa  1163    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  68.52 
 
 		 906 aa  1160    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  68.25 
 
 		 865 aa  1165    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  70.43 
 
 		 975 aa  1259    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  67.02 
 
 		 908 aa  1155    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  70.05 
 
 		 982 aa  1242    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  60.61 
 
 		 854 aa  1031    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  69.43 
 
 		 990 aa  1233    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  39.56 
 
 		 815 aa  569  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  43.78 
 
 		 754 aa  530  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  40.86 
 
 		 701 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  37.6 
 
 		 799 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  39.7 
 
 		 695 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  37.11 
 
 		 867 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  37.82 
 
 		 746 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  40.21 
 
 		 721 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  40.48 
 
 		 729 aa  445  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  41.58 
 
 		 686 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  39.76 
 
 		 689 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  39.08 
 
 		 722 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 		 729 aa  422  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  39.82 
 
 		 729 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  39.82 
 
 		 729 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  39.82 
 
 		 729 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  39.82 
 
 		 729 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  39.22 
 
 		 729 aa  422  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  39.82 
 
 		 729 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  39.82 
 
 		 729 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  39.52 
 
 		 729 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  39.37 
 
 		 729 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  37.18 
 
 		 731 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 		 729 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  39.87 
 
 		 620 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  39.89 
 
 		 873 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  37.04 
 
 		 731 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  38.3 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  38.01 
 
 		 730 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  36.18 
 
 		 718 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  33.54 
 
 		 777 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  34.23 
 
 		 719 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  33.66 
 
 		 768 aa  360  9e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  34.42 
 
 		 707 aa  356  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  33.02 
 
 		 712 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 675 aa  353  8.999999999999999e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  32.76 
 
 		 714 aa  351  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  32.41 
 
 		 714 aa  343  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  32.54 
 
 		 714 aa  343  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  32.54 
 
 		 714 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  33.07 
 
 		 714 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  32.28 
 
 		 714 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  32.28 
 
 		 714 aa  341  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  32.28 
 
 		 714 aa  341  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  32.28 
 
 		 714 aa  341  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  35.76 
 
 		 697 aa  341  5e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  32.28 
 
 		 714 aa  340  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  32.28 
 
 		 714 aa  340  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  35.01 
 
 		 711 aa  339  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  35.01 
 
 		 711 aa  339  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.16 
 
 		 608 aa  330  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 711 aa  329  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  33.07 
 
 		 741 aa  322  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1409  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 649 aa  322  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1425  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 649 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.864642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2048  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 649 aa  322  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.177023  normal  0.939846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1392  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 649 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.213648  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1877  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 649 aa  322  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000540839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>