76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0011 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 481 aa  932    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  47.07 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  40.12 
 
 		 504 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  36.59 
 
 		 490 aa  319  7e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 470 aa  93.6  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 480 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 899 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  35.14 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  28.57 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  19.43 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  29.38 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  22.67 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 		 489 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.3 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.3 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  20.84 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 487 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  21.08 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  23.67 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 509 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  19.31 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 546 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.32 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  20.32 
 
 		 506 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  19.75 
 
 		 500 aa  47  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 		 490 aa  47  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  19.16 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  19.73 
 
 		 482 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  24.89 
 
 		 544 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  25.79 
 
 		 544 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>