24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4577 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 452 aa  889    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  91.33 
 
 		 429 aa  714    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 449 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  27.43 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02808  hypothetical protein  28.22 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000016091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0713  polysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1505  hypothetical protein  26.58 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2493  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0697139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 444 aa  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 		 407 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.4 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 489 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  24.69 
 
 		 481 aa  43.5  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  30.84 
 
 		 479 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  21.21 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>