14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02859 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  100 
 
 		 449 aa  900    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0713  polysaccharide biosynthesis protein  99.44 
 
 		 355 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  99.33 
 
 		 449 aa  895    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  99.78 
 
 		 449 aa  899    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  99.55 
 
 		 449 aa  895    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  99.55 
 
 		 449 aa  897    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02808  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  715    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000016091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 429 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1505  hypothetical protein  24.23 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2493  polysaccharide biosynthesis protein  29.65 
 
 		 436 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0697139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>