14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3163 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  99.33 
 
 		 449 aa  895    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0713  polysaccharide biosynthesis protein  98.87 
 
 		 355 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 449 aa  902    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  99.11 
 
 		 449 aa  894    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  98.89 
 
 		 449 aa  890    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  99.33 
 
 		 449 aa  895    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02808  hypothetical protein  99.44 
 
 		 355 aa  711    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000016091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 452 aa  156  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1505  hypothetical protein  23.52 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2493  polysaccharide biosynthesis protein  29.92 
 
 		 436 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0697139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 490 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>