22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6369 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  91.33 
 
 		 452 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 429 aa  840    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  27.86 
 
 		 449 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02808  hypothetical protein  29.5 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000016091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0713  polysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1505  hypothetical protein  25.76 
 
 		 440 aa  99.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2493  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0697139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 407 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2496  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 490 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  24.69 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1698  hypothetical protein  28.98 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>