More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8097 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  100 
 
 		 471 aa  928    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.18 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  54.06 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  52.21 
 
 		 510 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 477 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 488 aa  312  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 496 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4754  GntR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 365 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  40.04 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 509 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 495 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 504 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 492 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 494 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 494 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 520 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 490 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 502 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 509 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  39.75 
 
 		 508 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.08 
 
 		 485 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.43 
 
 		 485 aa  286  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 502 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 502 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 501 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 516 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.11 
 
 		 488 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  38.45 
 
 		 492 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 480 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.26 
 
 		 470 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.89 
 
 		 488 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  37.88 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 520 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.48 
 
 		 485 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 488 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 501 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 493 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 487 aa  272  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.28 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.96 
 
 		 500 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.99 
 
 		 465 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.15 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.91 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.34 
 
 		 490 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 495 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.55 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 475 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  38.25 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.76 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.71 
 
 		 486 aa  261  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 492 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.56 
 
 		 491 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 490 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 503 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 481 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  40.31 
 
 		 487 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  38.65 
 
 		 492 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 502 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 569 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 502 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 484 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 502 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 490 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 490 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  39.01 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 488 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 503 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>