More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7850 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.61 
 
 
255 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185948  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.44 
 
 
257 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
255 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000312486  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
250 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.443482  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30491  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1363  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.49 
 
 
263 aa  215  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07016  oxidoreductase  45.7 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
260 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
260 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0824  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.92 
 
 
255 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
260 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4263  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.31 
 
 
257 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2070  hypothetical protein  44.27 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2080  hypothetical protein  45.12 
 
 
254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
253 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
256 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
256 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
261 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
246 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3892  putative oxidoreductase  41.27 
 
 
244 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.300054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
254 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
250 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  42.69 
 
 
243 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  43.65 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.977766  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
254 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 
257 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
250 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
276 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
260 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
244 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626733  normal  0.253561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
257 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
248 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
255 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
235 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
260 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.65 
 
 
245 aa  158  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
269 aa  158  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4885  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
235 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155643  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
262 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.3 
 
 
249 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
236 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.823656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
267 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
247 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
282 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
282 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
255 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
254 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
235 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
236 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
282 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
259 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
255 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
253 aa  155  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  38.43 
 
 
251 aa  154  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.52 
 
 
246 aa  155  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
272 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0302  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
236 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186456  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 
266 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
256 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
249 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
262 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.43 
 
 
250 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
258 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.52 
 
 
246 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
250 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
245 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
237 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
254 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
249 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
247 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5688  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
249 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
262 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
236 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>