266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5582 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  51.74 
 
 
1301 aa  1133    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1239 aa  2485    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  66.1 
 
 
1292 aa  1496    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  52.15 
 
 
1303 aa  1152    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  46.02 
 
 
1220 aa  1040    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  68.99 
 
 
1271 aa  1550    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  69.09 
 
 
1265 aa  1586    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.71 
 
 
1867 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  36.76 
 
 
1147 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  30.31 
 
 
1608 aa  347  8e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 
924 aa  336  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  40.2 
 
 
404 aa  282  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  40.2 
 
 
404 aa  282  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
740 aa  248  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
740 aa  248  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
732 aa  206  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
828 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
673 aa  102  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
441 aa  95.1  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.69 
 
 
2401 aa  94.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
447 aa  92.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
1067 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
539 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
953 aa  82  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
386 aa  82  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
418 aa  77.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
452 aa  74.3  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  25.83 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  26.43 
 
 
425 aa  70.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
1476 aa  67  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3945  hypothetical protein  38.95 
 
 
547 aa  67  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  30.29 
 
 
1444 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
391 aa  65.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
390 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
361 aa  64.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
367 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
445 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
733 aa  63.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
417 aa  62.4  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  28.17 
 
 
413 aa  61.6  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  36.79 
 
 
361 aa  61.6  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  30.33 
 
 
1121 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
413 aa  61.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
418 aa  60.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
440 aa  60.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
414 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
419 aa  59.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
1192 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
1400 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
445 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.13 
 
 
366 aa  58.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  21.51 
 
 
778 aa  57.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.1 
 
 
1191 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
405 aa  57.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
373 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
810 aa  58.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
359 aa  57.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
452 aa  57  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  24.78 
 
 
378 aa  57.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  30 
 
 
398 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  22.1 
 
 
401 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
462 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
814 aa  55.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
364 aa  55.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0155  hypothetical protein  40.59 
 
 
928 aa  55.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
413 aa  55.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
371 aa  55.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
397 aa  55.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
1287 aa  55.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
400 aa  54.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
393 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
1317 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
371 aa  54.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
414 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  24.02 
 
 
372 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  33.77 
 
 
361 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0239  glycosyl transferase group 1  51.92 
 
 
595 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
428 aa  53.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
361 aa  53.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
371 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
380 aa  53.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
436 aa  53.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  26.78 
 
 
331 aa  52.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
421 aa  52.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 
364 aa  52.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
360 aa  52.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
372 aa  52  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
1190 aa  52  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.68 
 
 
397 aa  51.6  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
354 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
354 aa  52  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  42.65 
 
 
354 aa  51.6  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
354 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
354 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
354 aa  51.6  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  42.65 
 
 
354 aa  51.6  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>