More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0545 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0545  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7632  transcriptional regulator, AraC family  81.9 
 
 		 116 aa  190  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  80.7 
 
 		 365 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3907  transcriptional regulator, AraC family  81.25 
 
 		 120 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2036  transcriptional regulator, AraC family  82.69 
 
 		 105 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3895  transcriptional regulator, AraC family  80.77 
 
 		 105 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  70.18 
 
 		 362 aa  157  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  67.54 
 
 		 372 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2426  transcriptional regulator, AraC family  72.38 
 
 		 105 aa  153  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 376 aa  150  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 367 aa  146  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  49.59 
 
 		 373 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  49.59 
 
 		 373 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  52.63 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  51.75 
 
 		 365 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  51.85 
 
 		 360 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  51.85 
 
 		 360 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0530  helix-turn-helix domain-containing protein  46.46 
 
 		 354 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  49.4 
 
 		 390 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 332 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 357 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 343 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 356 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 330 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 360 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 356 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 327 aa  72  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 334 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 355 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 360 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1556  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 386 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728217  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6273  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 348 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294899  normal  0.494705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 398 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 339 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 339 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 343 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 360 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1661  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6814  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 337 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 353 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 		 341 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 334 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 334 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 334 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2159  helix-turn-helix domain-containing protein  39.25 
 
 		 340 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 374 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 373 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 348 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  42.5 
 
 		 337 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 337 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 331 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 351 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 338 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2910  helix-turn-helix domain-containing protein  51.47 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.659583  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 364 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 347 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 364 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 353 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  38.39 
 
 		 355 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 352 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  41.25 
 
 		 353 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 366 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  41.11 
 
 		 330 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 331 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 345 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 337 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 343 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>