175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0046 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  100 
 
 		 605 aa  1196    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  83.31 
 
 		 605 aa  979    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  44.66 
 
 		 603 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.62 
 
 		 604 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 		 612 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 609 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  31.16 
 
 		 608 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  31.86 
 
 		 607 aa  335  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  33.66 
 
 		 608 aa  331  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.83 
 
 		 608 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  30.08 
 
 		 601 aa  316  6e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  30.08 
 
 		 610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  34.49 
 
 		 599 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  36.76 
 
 		 617 aa  306  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.83 
 
 		 608 aa  306  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 603 aa  300  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  30.18 
 
 		 561 aa  299  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.55 
 
 		 600 aa  299  8e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  32.39 
 
 		 615 aa  296  8e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  33.11 
 
 		 599 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  38.32 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.86 
 
 		 605 aa  290  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.68 
 
 		 604 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  36.92 
 
 		 565 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  28.85 
 
 		 647 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  26.48 
 
 		 681 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  28.42 
 
 		 652 aa  225  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  30.35 
 
 		 623 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  29.95 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.73 
 
 		 613 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25.45 
 
 		 624 aa  194  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  26.92 
 
 		 626 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.46 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  26.02 
 
 		 629 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  27.65 
 
 		 629 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  25.85 
 
 		 629 aa  183  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  25.4 
 
 		 637 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.91 
 
 		 644 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.38 
 
 		 618 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  26.39 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  24.53 
 
 		 641 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  25.8 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.32 
 
 		 606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  23.61 
 
 		 625 aa  174  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  24.12 
 
 		 626 aa  174  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  24.34 
 
 		 648 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  26.59 
 
 		 615 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  26.13 
 
 		 615 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  27.24 
 
 		 615 aa  171  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  25.51 
 
 		 615 aa  171  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  26.59 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  27.71 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  23.65 
 
 		 627 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  26.25 
 
 		 633 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  25.12 
 
 		 601 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  24.08 
 
 		 624 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.49 
 
 		 649 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  26.31 
 
 		 615 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26.07 
 
 		 645 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.28 
 
 		 637 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  30.13 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  27.99 
 
 		 663 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  24.43 
 
 		 625 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.74 
 
 		 660 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  26.03 
 
 		 646 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  26.63 
 
 		 618 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  24.32 
 
 		 628 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.5 
 
 		 650 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 635 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  25.04 
 
 		 620 aa  151  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.04 
 
 		 620 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  21.8 
 
 		 639 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.04 
 
 		 603 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.52 
 
 		 648 aa  150  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 596 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.8 
 
 		 633 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.04 
 
 		 603 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.04 
 
 		 603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  24.92 
 
 		 620 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  24.92 
 
 		 620 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  25.32 
 
 		 639 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  22.94 
 
 		 614 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  24.88 
 
 		 615 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.72 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  24.88 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  24.88 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  26.51 
 
 		 645 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.55 
 
 		 642 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  24.33 
 
 		 641 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.22 
 
 		 649 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 		 625 aa  139  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  26.84 
 
 		 603 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  23.68 
 
 		 644 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.24 
 
 		 636 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  25.45 
 
 		 646 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  24.56 
 
 		 634 aa  135  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.77 
 
 		 625 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  23.09 
 
 		 622 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>